一、 采集

1. 采集时，菌物样品应放在平底篮子或开口的盒子里，以减少对标本的损坏，不同标本分开放置;寄生植物类样品(植物病原菌，如锈菌等)放于信封内。

2. 每一个种类尽量采集多个不同发育阶段的标本。伞菌须采集完整的子实体。寄生性的种类须采集寄主植物标本以进行鉴定。

3. 信息记录：采集地点(GPS)、采集日期、生境、寄主等。记录应在采集同时完成，并为新鲜标本拍照，以记录形态特征、生境、寄主等信息。

二、 标本制备

1. 标本采集后应尽快干燥，使用电干燥器，60℃以下烘干标本。小型伞菌可整体干燥，大型伞菌、多孔菌可切成几部分干燥。

注意：请勿自然风干，以保护DNA质量。

2. 锈菌、黑粉菌等样品使用报纸和标本夹压制标本，定时更换干燥干净的报纸以保持标本干燥，防止发霉污染。

三、 组织块制备

菌组织块一般用于大型真菌DNA提取，将采集的样品切开，取内部干净未接触环境、空气的部分，用干净卫生纸将组织块包好，放于硅胶干燥。

注意：野外标本鉴定须提供样品组织块。